tert-Butyl 3-ethynylbenzoate นิยมใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในวงการเภสัชกรรมและเคมีอินทรีย์ เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันที่สามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย เช่น กลุ่มเอทิลีนที่สามารถใช้ในการทำปฏิกิริยา Click Chemistry ซึ่งเป็นกระบวนการที่สำคัญในการสร้างโมเลกุลขนาดใหญ่หรือโครงสร้างที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการพัฒนายาและการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อสร้างสารใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษาโรค