ใช้เป็นตัวกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมยาและสารเคมีละเอียด ทำหน้าที่เป็นโครงสร้างพื้นฐานในการสร้างเอสเทอร์และอีเทอร์ เนื่องจากมีกลุ่มเอสเทอร์และอีเทอร์ที่ทำปฏิกิริยาได้ ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์ยาชาเฉพาะที่และยาต้านอาริทเมีย นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมน้ำหอมและรสชาติเพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติทางกลิ่นที่ต้องการ กลุ่มเบนซิลออกซีสามารถถูกถอดออก (deprotect) ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการเคมีกลุ่มปกป้องระหว่างการสังเคราะห์หลายขั้นตอน