ใช้กรดไฮโดรฟลูอริกในการกัดกร่อนกระจกและวัสดุเซรามิกส์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมผลิตชิ้นส่วนอิเล็กทรอนิกส์ เช่น การผลิตชิปและแผงวงจร เพราะสามารถกัดซิลิคอนได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมปิโตรเลียมเพื่อทำให้บริสุทธิ์น้ำมัน โดยช่วยเร่งปฏิกิริยาการแครกกิ้งในกระบวนการผลิตเชื้อเพลิงคุณภาพสูง ยังมีการใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อย่อยสลายตัวอย่างแร่และวัสดุที่ทนต่อกรดอื่นๆ ได้ดี แต่ต้องใช้ด้วยความระมัดระวังสูงเนื่องจากมีพิษรุนแรงและก่อให้เกิดแผลไหม้รุนแรงได้