ไดแซนโทเจนถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเกษตรเป็นสารกำจัดวัชพืชและเชื้อรา โดยเฉพาะในการควบคุมวัชพืชในพืชไร่ เช่น อ้อย และข้าวโพด นอกจากนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการป้องกันและกำจัดโรคพืชที่เกิดจากเชื้อรา ช่วยเพิ่มผลผลิตและคุณภาพของพืชผล เนื่องจากประสิทธิภาพในการยับยั้งการเจริญเติบโตของวัชพืชและเชื้อราได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เป็นที่นิยมในหมู่เกษตรกร อย่างไรก็ตาม การใช้ไดแซนโทเจนต้องปฏิบัติตามคำแนะนำอย่างเคร่งครัดเพื่อลดผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมและสุขภาพของมนุษย์