5-Aminofluorescein ใช้เป็นสารเรืองแสงติดตามในงานวิจัยทางชีววิทยาและเคมี โดยมีความเข้มข้นการเรืองแสงสูง ทำให้เหมาะสำหรับการติดฉลากและติดตามโมเลกุลในกระบวนการทดลองต่างๆ ในเซลล์ชีววิทยา ใช้ศึกษาการซึมผ่านของเซลล์ พลวัตของเยื่อหุ้มเซลล์ และกระบวนการขนส่งภายในเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในกล้องจุลทรรศน์เรืองแสงเพื่อแสดงภาพโครงสร้างเซลล์และติดตามกิจกรรมของเซลล์มีชีวิต 5-Aminofluorescein ยังนำไปใช้ใน flow cytometry สำหรับการคัดแยกและวิเคราะห์เซลล์ ในชีวเคมี ทำหน้าที่เป็นโปรบสำหรับการทดสอบกิจกรรมเอนไซม์และปฏิกิริยาโปรตีน ความเข้ากันได้กับสารละลายน้ำและความเสถียรในสภาวะทางสรีรวิทยาช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการประยุกต์ใช้ทางวิทยาศาสตร์ที่หลากหลาย