Fluo-3, pentapotassium salt ใช้เป็นตัวบ่งชี้แคลเซียมในเซลล์ (calcium indicator) ในการศึกษาด้านชีววิทยาและชีวเคมี โดยเฉพาะในการติดตามการเปลี่ยนแปลงของระดับแคลเซียมภายในเซลล์ (intracellular calcium) ซึ่งมีความสำคัญในการวิจัยกระบวนการทางสรีรวิทยาและพยาธิวิทยา เช่น การส่งสัญญาณภายในเซลล์ (cell signaling) การหดตัวของกล้ามเนื้อ (muscle contraction) และการทำงานของระบบประสาท (neuronal activity) นอกจากนี้ยังใช้ในเทคนิคการถ่ายภาพด้วยกล้องจุลทรรศน์แบบฟลูออเรสเซนต์ (fluorescence microscopy) เพื่อให้เห็นการกระจายตัวและการเคลื่อนไหวของแคลเซียมในเซลล์อย่างชัดเจน