Super Fluor 488 ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนต์และการถ่ายภาพเซลล์ เนื่องจากมีฟลูออเรสเซนต์สีเขียวสว่างและความเสถียรภาพต่อแสงสูง มักใช้เป็นสารติดฉลากสำหรับโปรตีน แอนติบอดี และกรดนิวคลีอิก ช่วยให้นักวิจัยสามารถมองเห็นและติดตามกระบวนการทางชีวภาพในเซลล์ที่มีชีวิตหรือเซลล์ที่ยึดติดแล้ว ความเข้ากันได้กับชุดฟิลเตอร์ FITC มาตรฐานทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายใน flow cytometry, immunofluorescence assays, และ fluorescence in situ hybridization (FISH) นอกจากนี้ ยังใช้ใน molecular diagnostics สำหรับตรวจจับ biomarkers เฉพาะ และใน drug discovery สำหรับคัดกรองสารประกอบบำบัดที่เป็นไปได้ อัตราส่วนสัญญาณต่อ噪音 ที่ดีเยี่ยมช่วยเพิ่มความแม่นยำและความไวของผลการทดลอง