ใช้หลักๆ เป็นสาร derivatizing ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะสำหรับการตรวจจับและวัดปริมาณ primary amines และกรดอะมิโน มันทำปฏิกิริยาแบบเลือกสรรกับกลุ่มอะมิโนเพื่อสร้าง adducts ที่เสถียรและมีคุณสมบัติเรืองแสงหรือ chromophoric ทำให้มีคุณค่าใน high-performance liquid chromatography (HPLC) และ capillary electrophoresis โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่ม reactivity และ sensitivity ในการตรวจจับ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารตั้งต้นทางเภสัชกรรมที่ต้องการ building blocks ที่มีฟลูออรีนเพื่อปรับ biological activity โดยฟลูออรีนช่วยเพิ่มเสถียรภาพของโมเลกุล ความสามารถในการดูดซึมของยา และพัฒนายาใหม่ที่มีฤทธิ์เฉพาะเจาะจง ลดผลข้างเคียง เหมาะสำหรับงานวิจัยใน proteomics และ metabolomics เนื่องจากสามารถ label biomolecules ที่มี amine ได้อย่างมีประสิทธิภาพ รวมถึงการสร้างโครงสร้างไซคลิกหรืออะโรมาติกที่มีฟลูออรีนแทนที่ 2 ตำแหน่ง