4-Fluoro-7-nitrobenzofurazan ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเรืองแสงสำหรับการติดฉลากทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกระบวนการทางชีวเคมีในเซลล์ มีความไวสูงในการตรวจจับและสามารถใช้ในการวิเคราะห์ทางเคมีและชีวภาพ เช่น การติดตามโมเลกุลเป้าหมายในระบบชีวภาพ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยด้านเคมีวิเคราะห์เพื่อพัฒนาวิธีการตรวจวัดที่มีความแม่นยำและรวดเร็วมากขึ้น