ใช้ในการไบโอคอนจูเกชัน (bioconjugation) และการติดฉลาก (labeling) โดยเฉพาะในการพัฒนาโพรบเรืองแสง (fluorescent probes) สำหรับการถ่ายภาพ (imaging) และการวินิจฉัย (diagnostics) สารนี้มักใช้ในกล้องจุลทรรศน์เรืองแสง (fluorescence microscopy) การไหลของเซลล์ (flow cytometry) และการถ่ายภาพในร่างกาย (in vivo imaging) เนื่องจากมีฟลูโอโรโฟร์ Cy5 ที่ให้การปล่อยแสงใกล้แสงอินฟราเรด (near-infrared emission) ที่แรง สเปเซอร์ PEG3 ช่วยเพิ่มความละลายในน้ำ (solubility) และลดการขัดขวางเชิงโครงสร้าง (steric hindrance) ทำให้เหมาะสำหรับการติดกับชีวโมเลกุล (biomolecules) เช่น โปรตีน เปปไทด์ หรือแอนติบอดี โดยไม่รบกวนการทำงานของพวกเขา สารนี้มีคุณค่ามากในการศึกษากระบวนการทางเซลล์ (cellular processes) การติดตามปฏิสัมพันธ์โมเลกุล (tracking molecular interactions) และการออกแบบยาเฉพาะเจาะจง (targeted therapeutics)