Undecafluorohexanoyl Fluoride ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารลดแรงตึงผิวและโพลิเมอร์ที่มีฟลูออรีน โดยมีบทบาทสำคัญในการเพิ่มประสิทธิภาพของสารเคลือบ กาว และยาแนว ด้วยคุณสมบัติกันน้ำและกันน้ำมัน นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์วัสดุพิเศษสำหรับอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์ ซึ่งคุณสมบัติของมันช่วยในการพัฒนากระสลนนิกส์ประสิทธิภาพสูงและชั้นป้องกัน นอกจากนี้ ยังประยุกต์ใช้ในการสร้างโฟมดับเพลิงขั้นสูง เนื่องจากความสามารถในการก่อตัวเป็นฟิล์มที่เสถียรและทนความร้อน ในภาคเภสัชกรรม การใช้ในการเตรียมสารประกอบฟลูออรีนสำหรับการพัฒนายา โดยช่วยปรับปรุงความเสถียรและ bioavailability ของส่วนผสมออกฤทธิ์