Octafluoro-1,4-diiodobutane ใช้หลัก ๆ ในงานอุตสาหกรรมเฉพาะทาง โดยเฉพาะในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์และวิทยาศาสตร์วัสดุ โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งประกอบด้วยอะตอมฟลูออรีนและไอโอดีน ทำให้เป็นสารเคมีที่มีค่าซึ่งใช้ในการนำส่วนฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลอินทรีย์ ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายา พันธุ์พืชเคมี และวัสดุขั้นสูง สารประกอบนี้ยังถูกนำไปใช้ในการผลิตฟลูออโรโพลิเมอร์ และเป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารประกอบที่มีความเสถียรทางความร้อนและเคมีสูง นอกจากนี้ คุณสมบัติของมันยังเหมาะสมสำหรับการใช้ในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์ โดยสามารถนำไปใช้ในการผลิตเซมิคอนดักเตอร์และวัสดุประสิทธิภาพสูงอื่น ๆ