ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบฟลูออรีนที่แสดงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้น หมู่ไตรฟลูออโรมิไธล์ช่วยเพิ่มลิโพฟิลิกและมีผลดึงอิเล็กตรอน ทำให้มีคุณค่าในการปรับเปลี่ยนยาเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมพอลิเมอร์พิเศษและวัสดุฟังก์ชันนัลที่การฟลูออรีนช่วยให้มีความต้านทานความร้อนและสารเคมีที่ต้องการ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสร้างตัวเร่งปฏิกิริยาและลิแกนด์ใหม่สำหรับการสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริก