4-Fluorobenzylamine Hydroiodide ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งสารที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาทและหัวใจหลอดเลือด โครงสร้างอะโรมาติกที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาเรเดียโอฟาร์มาซูติคอลสำหรับการถ่ายภาพและวัตถุประสงค์การวินิจฉัย สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการวิจัยเพื่อออกแบบตัวยับยั้งและลิแกนด์ใหม่ในกระบวนการค้นพบยา