ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฟลูออรีนแทนที่ ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเพศได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างอนุพันธ์ในยาแก้ระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและมีผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมที่ดีกว่า การมีอะตอมฟลูออรีนช่วยอิทธิพลต่อลิโพฟิลิกและความสัมพันธ์ในการจับกับเป้าหมาย ซึ่งสำคัญในการปรับปรุงสารนำร่องระหว่างการค้นพบยา