เฮกซะฟลูออโรเบนซีนถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์เป็นของเหลวไดอิเล็กทริกและในการผลิตเซมิคอนดักเตอร์ เนื่องจากมีคุณสมบัติเป็นฉนวนที่ดีเยี่ยม มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอะโรมาติกฟลูออรีนต่างๆ ซึ่งจำเป็นในเภสัชกรรมและสารเคมีเกษตร ในเคมีอินทรีย์ ถูกใช้เป็นตัวทำละลายสำหรับปฏิกิริยาที่ต้องการสภาวะไม่ละลายในน้ำและเฉื่อย นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการผลิตโพลิเมอร์พิเศษและสารเคลือบ เพื่อเพิ่มความเสถียรทางความร้อนและเคมี คุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ยังทำให้มีคุณค่าในสเปกโทรสโกปีนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซนานซ์ (NMR) เป็นสารอ้างอิง