สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายาใหม่ๆ กลุ่มบอโรนิกแอซิดทำให้เป็นสารเคมีที่มีคุณค่าในการทำปฏิกิริยาครอสคัปเปลิงแบบ Suzuki-Miyaura ซึ่งใช้กันอย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน ส่วนของไพเพอราซีนเพิ่มศักยภาพในการออกแบบสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสารที่เล็งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลางหรือทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนี้ยังมีการสำรวจในการพัฒนาตัวแทนการถ่ายภาพ PET (positron emission tomography) เนื่องจากมีฟลูออรีน ซึ่งสามารถทำหน้าที่เป็นรังสีติดตามได้ นอกจากนี้ ลักษณะโครงสร้างของมันทำให้เป็นผู้สมัครในการศึกษาการโต้ตอบกับโปรตีนหรือตัวรับในเคมียารักษาโรค