เอทิล 2-(3,5-ไดเมทิลฟีนิล)-2,2-ไดฟลูออโรอะซิเตท ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารกลางที่หลากหลาย โครงสร้างที่มีกลุ่มไดฟลูออโรอะซิเตททำให้มีคุณค่าในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่อาจเกิดขึ้น การมีอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการย่อยสลายทางชีวภาพของโมเลกุลที่ได้ ทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในกระบวนการค้นพบยา นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ซึ่งคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้น บทบาทในวิทยาศาสตร์วัสดุก็เด่นชัด โดยสามารถใช้ปรับเปลี่ยนคุณสมบัติของโพลิเมอร์หรือสารเคลือบ ทำให้เพิ่มความทนทานหรือความต้านทานต่อปัจจัยสิ่งแวดล้อม