เมลามีนไฮโดรเจนฟลูออไรด์ใช้หลักๆ เป็นสารฟลูออรีนในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ ซึ่งช่วยในการนำอะตอมฟลูออรีนเข้าไปในสารประกอบอินทรีย์ต่างๆ เพื่อเพิ่มคุณสมบัติทางเคมีของสารเหล่านั้น นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมสารเคมีเฉพาะทางและยา ที่ต้องการสารกลางฟลูออรีน นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาเคมีบางชนิด เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรรในการเกิดปฏิกิริยา การประยุกต์ใช้นี้ยังขยายไปสู่ภาคอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์ โดยใช้ในการผลิตเซมิคอนดักเตอร์และส่วนประกอบอิเล็กทรอนิกส์อื่นๆ ที่ได้รับประโยชน์จากวัสดุที่มีฟลูออรีน