มะลาคีตกรีนใช้กันอย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำเป็นสารต้านเชื้อราและต้านปรสิตในการรักษาปลาและไข่ปลา โดยเฉพาะในการควบคุมการติดเชื้อราเช่นโรคซาปโรเลกนีเอシส (saprolegniasis) นอกจากนี้ยังมีคุณสมบัติต้านเชื้อแบคทีเรียบางชนิด ใช้เป็นสารฆ่าเชื้อในระบบเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำเพื่อป้องกันการแพร่กระจายของเชื้อโรค ในอุตสาหกรรมสิ่งทอใช้เป็นสีย้อมสำหรับผ้าไหม ขนสัตว์ และหนัง ให้สีเขียวสดใส ใช้ในงานย้อมสีทางชีววิทยาสำหรับกล้องจุลทรรศน์เพื่อเน้นโครงสร้างเซลล์ และในงานวิเคราะห์ทางเคมีเป็นตัวบ่งชี้หรือรีเอเจนต์ เช่น ในการตรวจวัดฟอสเฟต อย่างไรก็ตาม การใช้ถูกจำกัดหรือห้ามในหลายประเทศสำหรับสัตว์ที่ผลิตอาหารเนื่องจากความกังวลเรื่องพิษ สารก่อมะเร็ง และผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม ควรใช้ด้วยความระมัดระวัง