Bis-Mal-PEG3 ถูกใช้ในงาน bioconjugation และ crosslinking โดยทำหน้าที่เป็นโมเลกุลเชื่อมโยงเพื่อเชื่อมต่อ biomolecules เช่น โปรตีน เปปไทด์ หรือแอนติบอดี Spacer PEG (polyethylene glycol) ช่วยเพิ่มความละลายและลด steric hindrance ทำให้ประสิทธิภาพของกระบวนการ conjugation ดีขึ้น เนื่องจากมีกลุ่ม maleimide สองกลุ่มที่สามารถทำปฏิกิริยากับกลุ่ม sulfhydryl (-SH) ได้อย่างเฉพาะเจาะจง ใช้อย่างแพร่หลายในระบบนำส่งยา ช่วยสร้าง therapeutic agents ที่เสถียรและ targeted นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนา diagnostic tools และ research reagents เพื่อการ labeling และ detection ของ biomolecules ที่แม่นยำ โครงสร้าง trifunctional ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้หลากหลายใน chemical synthesis รวมถึงการตรึงโมเลกุลบนพื้นผิวและการประยุกต์ใช้ในนาโนเทคโนโลยีเพื่อสร้างโครงสร้างนาโนที่ซับซ้อน