Hydroxy-PEG3-NHS ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการคอนจูเกตของเปปไทด์และโปรตีน เพื่อเพิ่มความเสถียรและความสามารถในการละลายของโมเลกุลเป้าหมาย โดยเฉพาะในงานวิจัยทางชีววิทยาและเภสัชวิทยา ตัวเคมีนี้ช่วยในการเชื่อมต่อโมเลกุลต่างๆ ผ่านกลุ่ม NHS ester ที่สามารถทำปฏิกิริยากับกลุ่มอะมิโนได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้สามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างของสารชีวโมเลกุลได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตสารประกอบเพื่อการวินิจฉัยและยารักษาโรค โดยเฉพาะในระบบนำส่งยาแบบ targeted drug delivery ที่ต้องการความแม่นยำสูง