Hydroxy-PEG3-MS ใช้อย่างแพร่หลายในการไบโอคอนจูเกชันและระบบการส่งยา โดยทำหน้าที่เป็นลิงเกอร์เพื่อปรับปรุงความละลายและความเสถียรของสารประกอบทางยา โครงสร้าง PEG ที่ hydrophilic ช่วยเพิ่ม biocompatibility ทำให้มีคุณค่าในการบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมายและแอนติบอดี-ยาคอนจูเกต นอกจากนี้ ยังใช้ในการปรับแต่งพื้นผิวของนาโนพาร์ติเคิลเพื่อยืดระยะเวลาการไหลเวียนในกระแสเลือด การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยโปรตีโอมิกส์ ซึ่งช่วยในการติดฉลากและติดตามชีวโมเลกุล