Mal-PEG5-PFP ester ถูกใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการคอนจูเกตของโมเลกุลทางชีววิทยา โดยเฉพาะการเชื่อมต่อระหว่างเปปไทด์ โปรตีน และสารชีวโมเลกุลอื่น ๆ เนื่องจากมีกลุ่ม PFP ester ที่ทำปฏิกิริยาได้ดีกับกลุ่มอะมีน ทำให้เกิดพันธะที่เสถียร นอกจากนี้ กลุ่ม PEG5 ยังช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและลดการเกิดปฏิกิริยาที่ไม่จำเพาะ ทำให้สารนี้เป็นที่นิยมในงานวิจัยทางเภสัชวิทยาและชีววิทยาโมเลกุล เช่น การพัฒนายาเป้าหมายและการปรับปรุงประสิทธิภาพของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ