MS-PEG12-THP เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการเชื่อมต่อทางชีวภาพ (bioconjugation) และระบบการส่งมอบยา (drug delivery systems) โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นตัวเชื่อม (linker) เชื่อมต่อโมเลกุลบำบัดกับตัวแทนกำหนดเป้าหมายหรือพาหะ เพิ่มความเสถียรและความสามารถในการละลายของยา

สารนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการพัฒนาสารคอนจูเกตยาต้านแอนติบอดี (antibody-drug conjugates: ADCs) ซึ่งช่วยในการติดยาพิษ (cytotoxic drugs) เข้ากับแอนติบอดีสำหรับการบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการปรับเปลี่ยนโปรตีนและเพปไทด์เพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ (pharmacokinetic properties) เช่น การยืดระยะเวลาการไหลเวียนในร่างกาย

กลุ่ม THP (tetrahydropyran) ให้การป้องกันระหว่างการสังเคราะห์ เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรในโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน

ในทางปฏิบัติ MS-PEG12-THP ยังมีบทบาทสำคัญในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ โดยใช้เป็นตัวกลางในการสร้างสารประกอบใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะทาง เช่น การพัฒนาวัสดุนาโนและการศึกษาปฏิกิริยาระดับโมเลกุลในห้องปฏิบัติการ