Br-PEG3-C2-Boc ถูกใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์และกระบวนการ bioconjugation การประยุกต์ใช้หลักคือในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์และการพัฒนายา กลุ่มบรอมโมของสารประกอบช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ในขณะที่กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับอะมีน ทำให้สามารถถอดกลุ่มป้องกันได้อย่างเลือกสรรในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน

ตัวคั่น PEG (polyethylene glycol) ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและความเข้ากันได้ทางชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบระบบนำส่งยาและ bioconjugates นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาลิงก์เกอร์สำหรับ antibody-drug conjugates (ADCs) และการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายอื่นๆ ซึ่งการปล่อยออกมาอย่างควบคุมและความเสถียรมีความสำคัญ

นอกจากนี้ โครงสร้างของมันยังเหมาะสมสำหรับการปรับเปลี่ยนพื้นผิวหรือวัสดุสำหรับการใช้งานทางการแพทย์ชีวภาพ เช่น การฟังก์ชันนัลไลซ์นาโนพาร์ติเคิลหรือโครงนั่งร้านในวิศวกรรมเนื้อเยื่อ