1,1,1-ไตรฟลูออโรเอทิล-PEG4-อะมิโนออกซี ถูกนำไปใช้หลักในการไบโอคอนจูเกชันและเคมีชีวภาพสำหรับการดัดแปลงชีวโมเลกุล กลุ่มอะมิโนออกซีของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรกับสารประกอบที่มีคาร์บอนิล เช่น อัลดีไฮด์และคีโตน ทำให้มีคุณค่าต่อการติดฉลากโปรตีน เพปไทด์ และชีวโมเลกุลอื่นๆ สารเคมีนี้มักถูกนำมาใช้ในการพัฒนาคอนจูเกตแอนติบอดี-ยา (ADCs) ซึ่งช่วยในการติดตั้งโหลดยารักษาเข้ากับแอนติบอดี เพิ่มการส่งยาแบบกำหนดเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบ PEGylated ซึ่งปรับปรุงความสามารถในการละลาย ความเสถียร และเภสัชจลนศาสตร์ของยา กลุ่มไตรฟลูออโรเอทิลของมันยังให้ความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ทำให้มีประโยชน์ในการออกแบบโพรบและตัวแทนการถ่ายภาพสำหรับการวิจัยชีวการแพทย์