Bis-propargyl-PEG6 ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านเคมีชีวภาพและวัสดุศาสตร์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลเชิงซ้อนและการเชื่อมโยงทางเคมี เนื่องจากมีกลุ่ม propargyl ที่สามารถทำปฏิกิริยา click chemistry ได้อย่างมีประสิทธิภาพ เช่น ปฏิกิริยา azide-alkyne cycloaddition ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างโครงสร้างพอลิเมอร์หรือการปรับเปลี่ยนพื้นผิววัสดุ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนาระบบนำส่งยาและนาโนเทคโนโลยี โดยช่วยเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของตัวยา รวมถึงการออกแบบ biosensors และอุปกรณ์ทางการแพทย์ที่มีความแม่นยำสูง