M-Peg3-acid chloride ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่เกี่ยวข้องกับ PEGylation ซึ่งเป็นกระบวนการที่ใช้ในการปรับปรุงคุณสมบัติของยาและโมเลกุลชีวภาพ เช่น เพิ่มความเสถียร การละลายน้ำ และลดการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตสารเชื่อมโยง (linker) สำหรับการสร้างคอนจูเกตของยาและเปปไทด์ ซึ่งช่วยในการส่งมอบยาไปยังเป้าหมายได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในงานวิจัยด้านวัสดุศาสตร์เพื่อพัฒนาวัสดุที่มีความเข้ากันได้ทางชีวภาพสูง