m-PEG6-Ms ถูกใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการ bioconjugation และระบบการส่งยา เนื่องจากความสามารถในการปรับปรุงความละลาย ความเสถียร และ bioavailability ของสารประกอบบำบัด มันทำหน้าที่เป็น linker ในการสังเคราะห์ antibody-drug conjugates (ADCs) ซึ่งช่วยให้สามารถติดยา cytotoxic กับแอนติบอดีสำหรับการบำบัดมะเร็งแบบ targeted สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในกระบวนการ PEGylation ซึ่งปรับเปลี่ยนโปรตีน เพปไทด์ หรือโมเลกุลขนาดเล็กเพื่อเพิ่มคุณสมบัติ pharmacokinetic และลด immunogenicity นอกจากนี้ m-PEG6-Ms ยังถูกใช้ในการพัฒนา prodrugs ซึ่งช่วยให้การปล่อยยาแบบควบคุมและปรับปรุงประสิทธิภาพการบำบัด กลุ่ม mesylate ของมันช่วยให้การ conjugation กับ nucleophiles ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เป็น reagent ที่หลากหลายในเคมีอินทรีย์และเคมียารักษา