Mal-PEG2-NH-Boc ถูกนำไปใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในด้านชีวเคมีและเภสัชวิทยา เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่ม Maleimide และ Boc-protected amine ทำให้เหมาะสำหรับการเชื่อมต่อกับโมเลกุลทางชีวภาพ เช่น โปรตีนหรือเปปไทด์ กลุ่ม Maleimide ทำปฏิกิริยาได้ดีกับหมู่ Thiol ในซีสเทอีน ทำให้สามารถใช้ในการปรับเปลี่ยนโปรตีนหรือแอนติบอดีได้อย่างแม่นยำ ในขณะที่กลุ่ม Boc ช่วยป้องกันหมู่เอมีนในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาและการวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุล เพื่อสร้างสารประกอบใหม่ที่มีความเฉพาะเจาะจงและประสิทธิภาพสูง