MS-PEG3-dodecyl ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะในการปรับปรุงความสามารถในการละลายและความเสถียรของโมเลกุลเป้าหมาย มักใช้เป็นตัวเชื่อมหรือลิงเกอร์ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมี ช่วยให้โมเลกุลสามารถเกาะติดกับพื้นผิวหรือโครงสร้างอื่นได้ดีขึ้น นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในระบบนำส่งยาเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการดูดซึมและการกระจายตัวของยาในร่างกาย รวมถึงการประยุกต์ใช้ในนาโนเทคโนโลยีเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีของวัสดุ