MS-PEG3-dodecyl ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในด้านการเชื่อมต่อทางชีวภาพ (bioconjugation) และระบบนำส่งยา (drug delivery systems) คุณสมบัติ amphiphilic ของมัน ซึ่งรวมโซ่ dodecyl ที่ hydrophobic เข้ากับ spacer PEG ที่ hydrophilic ทำให้เป็นสารที่มีประสิทธิภาพในการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติพื้นผิวของอนุภาคนาโน (nanoparticles) ไลโปโซม (liposomes) และตัวนำยาอื่นๆ สารเคมีนี้มักถูกนำมาใช้เพื่อเพิ่มความสามารถในการละลาย (solubility) ความเสถียร (stability) และความเข้ากันได้ทางชีวภาพ (biocompatibility) ของยาที่ hydrophobic เพื่ออำนวยความสะดวกในการนำส่งไปยังเนื้อเยื่อเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนายาโปรดรัก (prodrugs) โดยลิงเกอร์ PEG3 สามารถถูกตัดขาด (cleaved) ภายใต้เงื่อนไขเฉพาะเพื่อปล่อยโมเลกุลยาที่ active ในงานวิจัย MS-PEG3-dodecyl ทำหน้าที่เป็นเครื่องมือที่หลากหลายสำหรับการสร้างพื้นผิวที่ถูกปรับแต่ง (functionalized surfaces) หรือสารคอนจูเกต (conjugates) ซึ่งช่วยให้สามารถศึกษาการโต้ตอบกับเยื่อหุ้มเซลล์ (cell membrane interactions) การนำส่งแบบกำหนดเป้าหมาย (targeted delivery) และกลไกการปล่อยแบบควบคุม (controlled release mechanisms) การประยุกต์ใช้นี้ยังขยายไปสู่การจัดทำไมเซลล์ (micelles) และโครงสร้างที่ประกอบตัวเอง (self-assembled structures) อื่นๆ สำหรับวัตถุประสงค์ทางบำบัด (therapeutic) และวินิจฉัย (diagnostic)