Ms-PEG8-Boc ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในด้านเคมีชีวภาพและเภสัชวิทยา เนื่องจากมีกลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ที่ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่ฟังก์ชันต่างๆ เช่น เอมีน ทำให้สามารถควบคุมปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ PEG (polyethylene glycol) ที่อยู่ในโครงสร้างยังช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในน้ำและลดความเป็นพิษของสาร ทำให้เหมาะสำหรับการพัฒนายาหรือโมเลกุลชีวภาพ เช่น การสร้างคอนจูเกตของยาและเปปไทด์ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการปรับเปลี่ยนพื้นผิวของวัสดุเพื่อเพิ่มความเข้ากันได้ทางชีวภาพ (biocompatibility) และลดการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันในร่างกาย