T-Butoxycarbonyl-peg2-sulfonic acid ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และกระบวนการ bioconjugation การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในการปรับเปลี่ยนเปปไทด์และโปรตีน โดยทำหน้าที่เป็น protecting group สำหรับกรดอะมิโนในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบ solid-phase สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาระบบส่งยา โดยเฉพาะการสร้างยา PEGylated ซึ่งช่วยเพิ่มความสามารถในการละลาย ความเสถียร และ bioavailability ของยารักษา นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการเตรียมโพลิเมอร์และพื้นผิวที่ functionalized สนับสนุนความก้าวหน้าในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุและนาโนเทคโนโลยี กลุ่ม sulfonic acid ยังช่วยให้สามารถใช้ในฐานะตัวเร่งปฏิกิริยา (catalysis) และสารลดแรงตึงผิว (surfactant) ในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ