สาร Propargyl-PEG4-methylamine นิยมใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลทางชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการเชื่อมต่อกับโมเลกุลอื่นผ่านปฏิกิริยา Click Chemistry ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่มีความจำเพาะและประสิทธิภาพสูง มักใช้ในการปรับเปลี่ยนเปปไทด์ โปรตีน หรือสารชีวโมเลกุลอื่น ๆ เพื่อเพิ่มการละลายหรือปรับปรุงคุณสมบัติทางเคมี นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและสารวินิจฉัยทางการแพทย์ โดยช่วยในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนและมีประสิทธิภาพ