Aureobasidin A ใช้เป็นสารต้านเชื้อราเป็นหลัก เนื่องจากความสามารถในการยับยั้ง inositol phosphorylceramide synthase ซึ่งเป็นเอนไซม์สำคัญในการสังเคราะห์ sphingolipid ทำให้มีประสิทธิภาพต่อเชื้อราโรคต่างๆ โดยเฉพาะในด้านการเกษตรเพื่อปกป้องพืชผลจากโรคเชื้อรา ในงานวิจัย ใช้เป็นเครื่องมือเลือกสรรเพื่อศึกษาการเผาผลาญ sphingolipid และบทบาทในกระบวนการเซลล์ นอกจากนี้ ยังมีศักยภาพในการพัฒนายารักษาโรคเชื้อราในมนุษย์ โดยให้แนวทางที่มุ่งเป้าไปที่การต่อสู้กับเชื้อราที่ดื้อยา กลไกการออกฤทธิ์ที่ไม่เหมือนใครทำให้เป็นสารประกอบที่มีคุณค่าในทั้งบริบทปฏิบัติและทดลอง