ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการพัฒนายาที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง พบว่าสารอนุพันธ์ของอินดาโซลมีศักยภาพในการยับยั้งเอนไซม์บางชนิด เช่น เอนไซม์ฟอสโฟไดเอสเทอเรส (PDE) ซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการอักเสบและโรคทางระบบประสาท จึงมีการนำไปใช้ศึกษาฤทธิ์ต้านการอักเสบ ฤทธิ์ต้านมะเร็ง และฤทธิ์ทางจิตเวชในโมเดลสัตว์ทดลอง นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารอ้างอิงหรือมาตรฐานในการวิเคราะห์ในห้องปฏิบัติการวิจัย