Phen-DC3 Trifluoromethanesulfonate ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษากลุ่มโครงสร้าง G-quadruplex โครงสร้างเหล่านี้เป็นการก่อตัวทุติยภูมิที่ไม่เหมือนใครของ DNA หรือ RNA ที่มีบทบาทในการควบคุมการแสดงออกของยีนและการบำรุงรักษาเทโลเมียร์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารทำให้ G-quadruplex เสถียรอย่างแรง ทำให้มีคุณค่าต่อการตรวจสอบหน้าที่ทางชีวภาพและการประยุกต์ใช้ทางบำบัดที่เป็นไปได้ มักใช้ในการทดลองเพื่อทำความเข้าใจกลไกของการแสดงออกของยีน การจำลอง DNA และการเสื่อมสภาพของเซลล์ นอกจากนี้ ยังใช้เป็นเครื่องมือในการค้นพบยาที่มุ่งเป้าไปยังโรคเช่นมะเร็ง ซึ่ง G-quadruplex มีส่วนเกี่ยวข้องในการควบคุม oncogene ความจำเพาะสูงและความสัมพันธ์ในการจับทำให้เป็น reagent สำคัญในศึกษาชีววิทยาโมเลกุลและเภสัชวิทยา