ฟาคโลเฟนถูกใช้ในการศึกษาทางวิทยาศาสตร์เพื่อทำความเข้าใจเกี่ยวกับระบบประสาท โดยเฉพาะในด้านของการวิจัยเกี่ยวกับรีเซพเตอร์ GABA_B ฟาคโลเฟนเป็นสารต้านการทำงานของรีเซพเตอร์ GABA_B ซึ่งช่วยในการศึกษาถึงบทบาทของรีเซพเตอร์นี้ในการควบคุมการส่งสัญญาณประสาท นอกจากนี้ ยังมีการใช้ฟาคโลเฟนในการวิจัยเกี่ยวกับโรคทางระบบประสาท เช่น โรคลมชัก และโรคทางจิตเวช เพื่อหาวิธีการรักษาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น