4-Nitrophenyl β-D-Fucopyranoside ใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารทดสอบในงานวิจัยทางชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในการศึกษาปฏิกิริยาไฮโดรไลซิสที่เกี่ยวข้องกับเอนไซม์ glycosidase สารนี้ช่วยในการวัดกิจกรรมของเอนไซม์เหล่านี้ เนื่องจากเมื่อเกิดปฏิกิริยาไฮโดรไลซิส จะได้ผลิตภัณฑ์ที่สามารถตรวจวัดได้ง่าย เช่น 4-nitrophenol ซึ่งแสดงสีเหลืองที่สามารถวัดได้ด้วยสเปกโตรโฟโตเมทรี นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิเคราะห์กลไกการทำงานของเอนไซม์และพัฒนายาใหม่ที่เกี่ยวข้องกับระบบเมตาบอลิซึมของคาร์โบไฮเดรต