MPT-NAG ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีวเคมีในฐานะสารตั้งต้นสำหรับเอนไซม์ โดยเฉพาะเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรต มันเป็นเครื่องมือสำคัญในการศึกษากลไกและจลนศาสตร์ของไกลโคซิเดสและเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องอื่นๆ ในสาขากไลโคไบโอโลจี MPT-NAG ถูกใช้ในการตรวจสอบโครงสร้างและหน้าที่ของไกลโคโปรตีนและไกลโคลิปิด ซึ่งช่วยในการทำความเข้าใจกระบวนการเซลล์และเส้นทางสัญญาณ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์และยารักษาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางเมแทบอลิซึม การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการทดสอบวินิจฉัย ซึ่งช่วยในการตรวจจับระดับกิจกรรมของเอนไซม์ในตัวอย่างทางคลินิก สนับสนุนการวินิจฉัยและติดตามโรคต่างๆ