5-Iodopentan-1-ol ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นที่หลากหลาย ทำหน้าที่เป็นชิ้นส่วนหลักในการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี สารประกอบนี้มักถูกใช้ในปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอฟิลิก ซึ่งอะตอมไอโอดีนสามารถถูกแทนที่ด้วยกลุ่มฟังก์ชันอื่นๆ ได้ง่าย ส่งผลให้สามารถสร้างโครงสร้างทางเคมีที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนายา การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่วิทยาศาสตร์วัสดุ โดยใช้ในการปรับเปลี่ยนโพลิเมอร์และการสร้างสารเคลือบพิเศษ