3-Chloro-1-butyne ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอินทรีย์หลายชนิด โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีภัณฑ์ มันถูกนำไปใช้ในการผลิตสารประกอบที่มีโครงสร้างเชิงซ้อน เช่น ยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการสังเคราะห์โพลีเมอร์และวัสดุพิเศษที่มีคุณสมบัติเฉพาะทาง ในการวิจัยทางเคมี 3-Chloro-1-butyne มักถูกใช้เป็นรีเอเจนต์ในปฏิกิริยาต่างๆ เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม ซึ่งช่วยในการพัฒนาสารเคมีใหม่ๆ ที่มีศักยภาพในการใช้งานหลากหลาย