ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารป้องกันเชื้อรา หมู่แทนที่ฮาโลเจนทำให้มีคุณค่าในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Ullmann สำหรับการสร้างโครงสร้างอะโรมาติกที่ซับซ้อน ยังนำไปใช้ในการผลิตสีย้อมและวัสดุฟังก์ชันนัลที่ฟีนอลฮาโลเจนช่วยเพิ่มความตอบสนองหรือความเสถียร ลวดลายฮาโลเจนที่เลือกสรรช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างควบคุมในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน