ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ขัดต่อระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการเตรียมตัวปรับตัวรับเซโรโทนินและสารประกอบอื่นๆ ที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาท นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ที่มีความเลือกสรรที่ดีขึ้น หมู่ไซโคลพรอพิลเมท็อกซีช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในผลิตภัณฑ์สุดท้าย ซึ่งเป็นประโยชน์ในการออกแบบยา