ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการเตรียมโมเลกุลอินทรีย์ซับซ้อนที่ต้องการปฏิกิริยาการจับคู่แบบเลือกสรร หมู่ฮาโลเจนช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบต่อเนื่องผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Heck couplings ซึ่งช่วยในการสร้างระบบอะโรมาติกที่ถูกแทนที่ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยที่กลุ่มไอโอโดและคลอโรทำหน้าที่เป็นจุดสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติม กลุ่มเมทอกซีช่วยเพิ่มความละลายและกำหนดทิศทางการแทนที่ด้วยเอเลคโทรไฟล์ในตำแหน่งเฉพาะระหว่างการสังเคราะห์