ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากโครงสร้างอะโรมาติกที่มีฟลูออรีนซึ่งช่วยเพิ่มการดูดซึมทางชีวภาพและความคงตัวทางเมแทบอลิซึม ความตอบสนองแบบเลือกสรรทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาเพื่อสร้างส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์ฟลูออรีนที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและโปรไฟล์สิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้น ใช้กันทั่วไปในเคมีศาสตร์การป้องกันพืชที่ซึ่งการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่ม lipophilicity และการทะลุผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเพื่อพัฒนาสารประกอบฟลูออรีนใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่ปรับแต่งได้