ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างอะโรมาติกที่มีฟลูออรีนทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาส่วนประกอบที่ออกฤทธิ์ซึ่งต้องการความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่เพิ่มขึ้นและการดูดซึมทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากคุณสมบัติดึงอิเล็กตรอนของหมู่ไนโตรและฟลูออรีน ซึ่งช่วยปรับปรุงความสัมพันธ์ในการจับและความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสำหรับการออกแบบสารประกอบใหม่ในเคมียารักษาโรค โดยเฉพาะในการพัฒนาอนาล็อกฟลูออรีนที่มีโปรไฟล์เภสัชจลนศาสตร์ที่ปรับปรุงแล้ว