ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฟลูออรีนเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาในการออกแบบส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ยังถูกใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากอะตอมฟลูออรีนมีผลต่อการผ่านเยื่อหุ้มเซลล์และการจับกับเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้เป็นบล็อกก่อสร้างในสูตรของเหลวคริสตัลสำหรับเทคโนโลยีหน้าจอแสดงผล ซึ่งการมีฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความต่างทางไดอิเล็กทริกและความเสถียรทางความร้อน