2-Iodo-6-methoxybenzoic acid ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่มีทั้งหมู่ไอโอดีนและเมทอกซี่ ทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ในเคมียารักษาโรค มักใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพในการรักษาโรคต่างๆ นอกจากนี้ หมู่ไอโอดีนช่วยให้สามารถทำการปรับโครงสร้างเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Sonogashira ซึ่งจำเป็นในการสร้างห้องสมุดสารเคมีที่หลากหลายสำหรับการค้นพบยา ในงานวิจัยสารเคมีเกษตร ใช้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการออกแบบสารกำจัดวัชพืช เชื้อรา หรือแมลงที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้น ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในการพัฒนาการวิจัยในสาขาเคมีและวิทยาศาสตร์ชีวิต